Jalur Tanpa Tes
Jalur dibuka untuk prodi S1 Farmasi & D3 Farmasi. Calon pendaftaran adalah siswa yang akan lulus SMA/SMK sederajat tahun berjalan dengan melampirkan nilai raport. jalur ini memiliki kuota terbatas
Jalur Prestasi
Jalur dibuka untuk prodi S1 Farmasi & D3 Farmasi. Calon pendaftaran adalah siswa yang akan lulus SMA/SMK sederajat tahun berjalan dengan melampirkan nilai raport dan dokumen prestasi (Akademik atau Non-Akademik) pada tingkat Kabupaten/Kota, Provinsi, Regional, Nasional atau Internasional. jalur ini memiliki kuota terbatas
Jalur Tes Reguler
Jalur dibuka untuk prodi S1 Farmasi & D3 Farmasi. Calon pendaftaran adalah kalangan umum dengan background pendidikan SMA/MA bidang IPA atau SMK bidang Farmasi/Kesehatan.
Jalur Tes Kelas Karyawan
Jalur ini khusus dibuka untuk Prodi D3 Farmasi. Calon pendaftar Kelas Karyawan harus berasal dari lulusan Sekolah Menengah Farmasi (SMF)/SMK Farmasi dan telah bekerja yang dibuktikan dengan surat keterangan atau SK dari tempat bekerja.
Jalur S1 RPL Transfer SKS
Jalur ini dikhususkan bagi lulusan D3 Farmasi, dengan persyaratan yang memenuhi ketentuan yaitu verifikasi ijazah dan transkrip nilai sebagai bukti telah selesai menempuh pendidikan pada Program Studi D3 Farmasi dan berasal dari Program Studi D3 Farmasi yang terakreditasi.
Jalur Pindahan
Sekolah Tinggi Farmasi Mahaganesha membuka jalur Penerimaan Mahasiswa Baru Program Jalur Pindahan dari Program Studi Farmasi pada jenjang pendidikan yang sama dengan perguruan tinggi asal